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环亚集团的TOPO克隆实验流程与注意事项

发布时间:2025-03-23   信息来源:龙菊谦

二、TOPO克隆PCR产物的纯化回收

环亚集团的TOPO克隆实验流程与注意事项

1. PCR反应结束后,首先需进行琼脂糖凝胶电泳鉴定,以确认是否存在目的大小的条带。

2. 建议采用切胶回收法进行纯化(切胶时间最好控制在3分钟内,以避免紫外线对DNA的损伤)。使用NanoDrop或OneDrop等仪器检测回收的浓度,确保浓度≥30ng/μl,并再次通过电泳确认仅存在目的条带。

3. 目的片段连接到载体时,按照说明书要求准备连接反应体系,每组分的投入体积应≥1μl。如浓度过高,可进行稀释;连接反应的温度可设置为25°C或37°C,时间可设为5分钟。如果出现克隆失败或得到空载体/假阳性结果,可考虑将时间延长至30分钟。

4. 感受态细胞转化与涂板过程:选择使用DH5α、Fast-T1等用于克隆的化学感受态细胞进行转化;感受态细胞不宜重复冻融,建议在-80°C取出后一次性使用。重组产物与感受态细胞体积的比例应为1:10,推荐将10μl重组产物加入至100μl感受态细胞,或将5μl重组产物加入至50μl感受态细胞中进行热激转化,热激时间建议遵循感受态细胞的说明书操作。在涂板时,所用平板的抗生素应与转化载体的抗性相匹配。

5. 涂板前,先将菌液离心(2500×g,3分钟),用移液枪吸去多余的LB培养基,保留100μl重悬液后进行整体涂板,或吸取适合的体积进行涂板。

单克隆菌落PCR鉴定

1. 从平板中挑取体积适中的单克隆菌落,避免选择过大或过小的菌落。

2. 多选择几个单克隆菌落进行鉴定分析。

3. 将挑取的菌落放入已添加10μl ddH2O的15ml或2ml EP管中,充分混匀后吸取1-2μl作为PCR反应(10/20μl体系)的模板。

4. 推荐使用一对分别位于片段和载体的上下游引物进行PCR鉴定。

在处理模板中存在Amp/kana抗性的质粒时,应对目的片段进行切胶回收。

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